Leczenie kanałowe pod mikroskopem dentysta endodonta realizuje przeważnie w najcięższych sytuacjach. Z reguły leczenie kanałowe wymagane będzie w sytuacji, jeśli miazga zęba jest głęboko zainfekowana przez próchnicę, co powoduje, że ząb niszczy się od wewnątrz. Zwykle powodem wykonywanego w klinice dentystycznej zabiegu endodontycznego są też martwica i zgorzele miazgi i zmiany w pobliżu wierzchołka, obumarcie lub głębokie starcie zębów. Zdarza się, że zabieg endodontyczny pod mikroskopem trzeba przeprowadzić, jeżeli na skutek wypadku dochodzi do odkrycia miazgi zębowej.
Istnieją również tego typu przypadki leczenia endodontycznego, co nie wynikają z urazów i chorób. Przykładem tego może być nieprawidłowo wykonany uprzednio zabieg, przez co w kanale zęba zaklinowało się odłamane narzędzie dentystyczne. Dentysta endodonta powinien pomóc również w sytuacji niedrożności kanału. Zablokowanie przeważnie występuje na skutek zwężenia lub zrośnięcia się kanałów, skomplikowanego przebiegu lub ze względu na jego niepoprawne wypełnienie. Czasem zabieg endodontyczy potrzebny jest też po zdjęciu wkładu korzeniowo-koronowego.
Leczenia endodontycznego nie trzeba się obawiać, niezależnie od problemu, z którym pacjent zgłasza się do dentysty endodonty. We współczesnej stomatologii w sumie każdy zabieg przeprowadzany jest pod znieczuleniem, z uwagi na to zabiegi są bezbolesne. Znacznie lepiej zgłosić się do stomatologa, aby coś poradził i przeprowadził leczenie, niż pozwolić na dalszy rozwój problemu.